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數(shù)據(jù)架構(gòu)對推動人工智能和醫(yī)學的未來發(fā)展至關(guān)重要

大數(shù)據(jù) 人工智能
新冠疫情不僅凸顯了速度對醫(yī)學發(fā)現(xiàn)的重要性,而且還凸顯了數(shù)據(jù)科學和人工智能為這種加速提供幫助的重要性。

新冠疫情不僅凸顯了速度對醫(yī)學發(fā)現(xiàn)的重要性,而且還凸顯了數(shù)據(jù)科學和人工智能為這種加速提供幫助的重要性。例如,機器學習在醫(yī)學領(lǐng)域的應用近年來取得了重大進展,通過人工智能發(fā)現(xiàn)的藥物分子已經(jīng)用于人體試驗。盡管如此,英國艾倫圖靈研究所最近發(fā)布的一份調(diào)查報告表明,數(shù)據(jù)收集、使用、存儲、處理和與不同系統(tǒng)集成的困難(即缺乏強大的數(shù)據(jù)架構(gòu)),阻礙了采用人工智能工具以應對新冠疫情的努力。

為了充分挖掘人工智能的潛力,企業(yè)需要整理好他們的數(shù)據(jù),尤其是醫(yī)療機構(gòu)和制藥廠商。

數(shù)據(jù)日益重要

盡管很多醫(yī)療機構(gòu)和制藥廠商在藥物和醫(yī)學發(fā)現(xiàn)等方面付出了巨大努力,特別是針對新冠病毒進行開發(fā),但它是一個漫長、復雜且成本高昂的過程。更不用說其成功率很低——根據(jù)調(diào)查,藥物開發(fā)的整體失敗率高達96%。這就是數(shù)據(jù)可以發(fā)揮重要作用的地方,需要更新方法,提高藥物開發(fā)的潛力,以降低失敗率。

如果沒有人類基因組數(shù)據(jù),就無法全面捕捉導致疾病的所有元素,從而無法獲得更廣泛、更深入的了解。這就需要進行大規(guī)模基因組測序,以便能夠發(fā)現(xiàn)和驗證關(guān)鍵的遺傳變異。收集到的更多信息和見解可以讓企業(yè)可以采取更明智的措施,降低藥物開發(fā)失敗率。利用這些數(shù)據(jù)創(chuàng)建機器學習算法也可以實現(xiàn)藥物開發(fā)管道的自動化,加速藥物發(fā)現(xiàn)。

另一個例子是,QSAR(定量結(jié)構(gòu)-活性關(guān)系)模型能夠通過減少合成的藥物化合物數(shù)量來提高對新化學結(jié)構(gòu)的預測準確性,并降低成本和時間。通過轉(zhuǎn)移知識和結(jié)合從豐富的歷史數(shù)據(jù)中學習,預測分析也可以用于藥物開發(fā)和生產(chǎn)。然后可以使用這些數(shù)據(jù)來發(fā)現(xiàn)新藥物,并加快開展實驗。

人工智能已經(jīng)在藥物開發(fā)、發(fā)現(xiàn)和臨床試驗過程中發(fā)揮重要作用,使研究機構(gòu)有機會通過現(xiàn)代數(shù)據(jù)和分析方法加速臨床研究。

數(shù)據(jù)的挑戰(zhàn)

盡管取得了這些進步,但分析這些數(shù)據(jù)都帶來了自身的挑戰(zhàn)。現(xiàn)在有如此多的生物和醫(yī)學數(shù)據(jù)可用,要快速獲取所需的見解比以往任何時候都要困難。如果不能正確利用這些數(shù)據(jù),就毫無意義。此外,基因組數(shù)據(jù)尤其需要大量存儲、專門的軟件來分析它并引發(fā)許多數(shù)據(jù)管理、數(shù)據(jù)共享以及隱私和安全問題——重要的是要記住這些通常是高度敏感的私人信息。

研究機構(gòu)和廠商面臨的問題是,這些數(shù)據(jù)通常是高度分散的,使用傳統(tǒng)架構(gòu)難以支持對這么多不同數(shù)據(jù)的分析。僅是找到用于分析所需的正確數(shù)據(jù)就可能需要花費數(shù)周的時間。

生物技術(shù)開發(fā)商Regeneron公司當時就面臨著這些問題,因此致力于解決處理性能和可擴展性問題。該公司面臨的問題是,其數(shù)據(jù)團隊沒有分析可用的PB級基因組和臨床數(shù)據(jù)所需的資源;不能充分利用自己收集的數(shù)據(jù)。雖然現(xiàn)在能夠收集比以往更多的數(shù)據(jù),但還要努力處理這些海量數(shù)據(jù)集。

數(shù)據(jù)架構(gòu)的作用

這就是Data lakehouses可以發(fā)揮重要作用的地方。醫(yī)療機構(gòu)簡化其基礎(chǔ)設(shè)施和運營以提高生產(chǎn)力和成功概率至關(guān)重要。只有將數(shù)據(jù)全部集中在一個統(tǒng)一且易于訪問的數(shù)據(jù)分析平臺中(例如Lakehouse),數(shù)據(jù)才能充分發(fā)揮其潛力。簡化的Lakehouse基礎(chǔ)設(shè)施可實現(xiàn)更大的可擴展性、自動化和大規(guī)模機器學習,以加速藥物開發(fā)。統(tǒng)一平臺還可以創(chuàng)建交互式工作空間,以提高藥物生命周期各階段的透明度和協(xié)作。數(shù)據(jù)和見解可以在團隊之間輕松共享,同時確保可靠性和維護安全性以保護敏感數(shù)據(jù)。因此,為了更快地發(fā)現(xiàn)藥物和治療方法,需要加快整體藥物靶點識別速度,開發(fā)團隊可以同時在多個疾病領(lǐng)域開展工作。

另一方面,處理傳統(tǒng)架構(gòu)和復雜的基礎(chǔ)設(shè)施很費時間,尤其是設(shè)置正確的基礎(chǔ)設(shè)施并進行維護以支持必要的分析。這使開發(fā)團隊難以專注于分析。通過提高自動化程度,例如在出現(xiàn)任何系統(tǒng)故障時自動切換集群管理之類的操作,團隊可以在DevOps上花費更少的時間,并專注于更高價值的任務,即藥物開發(fā)和發(fā)現(xiàn)新的治療方法。當Regeneron公司采用提供更強大數(shù)據(jù)架構(gòu)的新平臺之后,找到用于分析的正確數(shù)據(jù)從三周縮短到兩天,可以幫助支持更廣泛的研究。因此,數(shù)據(jù)架構(gòu)是使數(shù)據(jù)可用并能夠回答改進藥物發(fā)現(xiàn)的問題的關(guān)鍵。

除了實現(xiàn)臨床可預測性和對數(shù)據(jù)沿襲的訪問之外,Lakehouse平臺還允許研究人員利用可重復的、基于機器學習的系統(tǒng)來生成和驗證假設(shè),從而使他們能夠?qū)ψ约旱臅r間和研究做出更有針對性的決定。

真正發(fā)揮數(shù)據(jù)的潛力

數(shù)據(jù)在醫(yī)療保健行業(yè)中具有至關(guān)重要的作用,特別是在藥物和醫(yī)學發(fā)現(xiàn)方面,但企業(yè)現(xiàn)在必須進一步推動這一點,以充分利用數(shù)據(jù)的潛力。如果沒有強大的數(shù)據(jù)架構(gòu),藥物發(fā)現(xiàn)之類的高失敗率不會很快降低,通過集中的、可擴展的平臺來簡化操作,企業(yè)可以獲得他們需要的見解,并加速藥物發(fā)現(xiàn)。整理數(shù)據(jù)只是第一步,下一步是建立必要的數(shù)據(jù)架構(gòu)。

 

責任編輯:姜華 來源: 企業(yè)網(wǎng)D1Net
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